Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms