Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF316A6NFI3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms