Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPH3AQ9Y2J0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPH3AQ9Y2J0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms