Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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