Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGXB4Q9UGU5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms