Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R1BQ9UD71 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms