Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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