Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms