Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms