Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms