Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms