Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms