Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms