Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms