Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms