Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms