Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms