Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms