Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms