Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E3Q969T4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms