Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms