Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF12Q8WXF0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF12Q8WXF0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms