Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXP5

C11orf53, Uncharacterized protein C11orf53, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf53Q8IXP5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf53Q8IXP5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf53Q8IXP5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms