Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71Q8IV32 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms