Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms