Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms