Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATL3Q6DD88 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATL3Q6DD88 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATL3Q6DD88 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms