Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms