Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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