Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms