Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms