Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms