Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms