Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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