Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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