Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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RPE65Q16518 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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