Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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