Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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