Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD1Q15327 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD1Q15327 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD1Q15327 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD1Q15327 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD1Q15327 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD1Q15327 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD1Q15327 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD1Q15327 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD1Q15327 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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