Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PCM1Q15154 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms