Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EEA1Q15075 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EEA1Q15075 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
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