Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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