Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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GBX1Q14549 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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GBX1Q14549 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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GBX1Q14549 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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GBX1Q14549 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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GBX1Q14549 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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GBX1Q14549 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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