Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK13Q14004 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
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