Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOFQ13790 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOFQ13790 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOFQ13790 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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APOFQ13790 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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APOFQ13790 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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APOFQ13790 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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APOFQ13790 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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