Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMB3Q13751 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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