Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
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