Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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