Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PTK7Q13308 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PTK7Q13308 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PTK7Q13308 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PTK7Q13308 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PTK7Q13308 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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PTK7Q13308 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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PTK7Q13308 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms