Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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